La gentiane d’automne atteint une hauteur de 5 à 25 cm et elle préfère les endroits ensoleillés, calcaires, pauvres en nutriments et à humidité très variable. Elle prospère également dans les pâturages de montagne, car sa forte teneur en substances amères la rend peu appétissante pour les animaux. La gentiane fleurissant entre août et octobre, la tonte précoce des prairies maigres est une vraie menace pour elle.